Чтобы не использовать дорогущий интернет в роуминге можно было купить местную туристическую симкарту. Две ведели 4G интернета за 3,5 - 4 тысячи йен, однако без возможности звонить и отправлять/получть смс - но скайп легко решает эту проблему.

Единственная проблема - заказывать его надо заранее, в самой Японии его не купить - исключительно гайдзинская привилегия.

А ещё можно было не париться с покупкой билетов в автоматах, а платить специальной картой - Suica или Pasmo (есть ещё несколько, но эти вроде самые популярные)

Ну не скажи. Достаточно трёх-четрёх поездок на шинкансене, чтобы окупить JRP. Чтобы не быть голословным, возьмем конкретный цены: на japan-rail-pass.com недельный проездной стоит 230$, что чуть меньше 30к йен по текущему курсу. Доехать, например, от Токио до Хиросимы в одну сторону - 11к йен. Так что выгода очевидна. На городских электричках конечно да, нужно сильно постараться чтобы оккупить стоимость.